肯尼迪总统被暗杀的前几分钟，肯尼迪与夫人杰基·肯尼迪，以及得克萨斯州州长约翰·康纳利坐在总统车内。
美国第35任总统约翰·F·肯尼迪于1963年11月22日在德克萨斯州达拉斯市的迪利广场乘坐总统车队时遇刺。肯尼迪与妻子杰奎琳、德克萨斯州州长约翰·康纳利及其妻子内莉同车，当时他被前美国海军陆战队员李·哈维·奥斯瓦尔德从附近的德克萨斯教科书仓库开枪射杀。车队迅速赶往帕克兰纪念医院，肯尼迪在枪击后约30分钟被宣布死亡；康纳利也在袭击中受伤，但后来康复。副总统林登·B·约翰逊在两小时八分钟后在达拉斯爱田机场的空军一号上匆忙宣誓就任总统。
刺杀后，奥斯瓦尔德回家取回一把手枪；不久后他开枪杀死了独自一人的达拉斯警察J·D·蒂皮特。在肯尼迪和康纳利被枪击后约70分钟，奥斯瓦尔德被达拉斯警察局逮捕，并根据德克萨斯州法律被指控谋杀肯尼迪和蒂皮特。两日后，即1963年11月24日上午11:21，当电视直播摄像机拍摄奥斯瓦尔德被转移穿过达拉斯警察总部地下室时，他被达拉斯夜总会经营者杰克·鲁比开枪射杀。与肯尼迪一样，奥斯瓦尔德被送往帕克兰纪念医院，不久后死亡。鲁比被判谋杀奥斯瓦尔德罪，但该判决在上诉后被推翻，鲁比在1967年等待新审判时在监狱中去世。
经过10个月的调查，沃伦委员会得出结论，奥斯瓦尔德刺杀了肯尼迪，并没证据说明奥斯瓦尔德或鲁比是阴谋的一部分。1967年，新奥尔良地区检察官吉姆·加里森对商人克莱·肖提起肯尼迪谋杀案的唯一审判；肖被无罪释放。随后的联邦调查——如洛克菲勒委员会和丘奇委员会——同意沃伦委员会的一般调查的最终结果。在其1979年的报告中，美国众议院暗杀特别委员会（HSCA）得出结论，肯尼迪很可能是“作为阴谋的结果被刺杀”。HSCA没有指认可能的阴谋者，但得出结论认为“有很高的概率有两名枪手向总统开枪”。HSCA的结论主要基于后来被美国司法部揭穿的警方Dictabelt录音。
肯尼迪的刺杀仍然是广泛辩论的主题，并催生了许多阴谋论和替代情景；民意调查发现，绝大多数美国人相信存在阴谋。这次刺杀留下了深远的影响，是1960年代美国四次重大刺杀事件中的第一次，之后两年是1965年马尔科姆·X的刺杀，五年后是1968年马丁·路德·金和肯尼迪的兄弟罗伯特的刺杀。2025年1月，唐纳德·特朗普总统签署的第14176号行政命令旨在解密有关刺杀的记录。肯尼迪是第四位被刺杀的美国总统，也是最近一位在任内去世的总统。
1960年，来自马萨诸塞州的美国参议员约翰·F·肯尼迪与林登·B·约翰逊作为副总统候选人搭档，当选为美国第35任总统。肯尼迪的任期见证了冷战的顶峰，他的大部分外交政策都致力于对抗苏联和。作为总统，他授权推翻古巴政府菲德尔·卡斯特罗的行动，这在1961年以失败告终的猪湾入侵中达到高潮，在此期间他拒绝直接派遣美国军队。次年，肯尼迪缓和了古巴导弹危机，这一事件被广泛认为是人类最接近核战争的时刻。
1963年，肯尼迪决定前往德克萨斯州，以缓和该州内自由派美国参议员拉尔夫·亚伯勒和保守派州长约翰·康纳利之间的摩擦。这次访问是在6月肯尼迪、约翰逊和康纳利在埃尔帕索的一次会议上首次商定的。车队路线日最终确定并很快宣布。肯尼迪还将这次德克萨斯之行视为他1964年连任竞选的非正式启动。
李·哈维·奥斯瓦尔德（中间）等人在新奥尔良分发支持卡斯特罗的传单，1963年8月16日。
李·哈维·奥斯瓦尔德（1939年出生）是一名前美国海军陆战队员，曾在日本和菲律宾服役，自14岁阅读卡尔·马克思的作品后便信奉。在意外用没有经过授权的手枪射伤手肘并与一名军官打架后，奥斯瓦尔德两次受到军事法庭审判并被降级。1959年9月，他在声称母亲残疾后获得了家属赡养退伍。19岁的奥斯瓦尔德乘坐货船从新奥尔良前往法国，然后前往芬兰，在那里获得了苏联签证。
奥斯瓦尔德叛逃到苏联，并于1960年1月被派往白俄罗斯明斯克的一家工厂工作。1961年，他遇到了玛丽娜·普鲁萨科娃并与之结婚，两人育有一子。1962年，他通过美国大使馆的遣返贷款返回美国。他在达拉斯/沃思堡地区定居，在那里与俄罗斯移民——尤其是乔治·德·莫伦希尔德——交往。1963年3月，一颗子弹险些击中埃德温·沃克将军在达拉斯的住所；一名目击者看到了两个可疑男子。根据玛丽娜的证词、奥斯瓦尔德留下的便条和弹道证据，沃伦委员会将这次暗杀企图归咎于奥斯瓦尔德。
1963年4月，奥斯瓦尔德回到他的出生地新奥尔良，并成立了一个独立的支持卡斯特罗的“古巴公平委员会”分会，他是该分会的唯一成员。在与身份不明的同伴分发支持卡斯特罗的传单时，奥斯瓦尔德因与反卡斯特罗的古巴流亡者发生冲突而被捕。1963年9月底，奥斯瓦尔德前往墨西哥城，根据沃伦委员会的说法，他访问了苏联和古巴大使馆。10月3日，奥斯瓦尔德返回达拉斯，并在迪利广场的德克萨斯教科书仓库找到工作。在工作日，他与玛丽娜分开居住在达拉斯的一家寄宿公寓。在刺杀当天的早晨，他将一个长包裹（他告诉同事里面装的是窗帘杆）带入仓库；沃伦委员会得出结论，这个包裹里装的是奥斯瓦尔德拆卸的步枪。
肯尼迪抵达达拉斯及前往迪利广场的路线日，肯尼迪总统和杰奎琳·肯尼迪抵达达拉斯爱田机场
肯尼迪车队穿过迪利广场的路线。枪击发生在埃尔姆街（Elm Street）。
11月22日，空军一号于上午11:40抵达达拉斯爱田机场。肯尼迪总统和登上了一辆1961年林肯大陆敞篷豪华轿车，前往达拉斯贸易市场参加午宴。这辆车——车队中的第二辆——的其他乘客包括特勤局特工比尔·格里尔（驾驶员）、前排乘客座的特工罗伊·凯勒曼，以及坐在肯尼迪夫妇前面的康纳利州长及其妻子内莉。四名达拉斯警察骑摩托车护送肯尼迪的豪华轿车。副总统约翰逊、他的妻子伯德夫人和参议员亚伯勒乘坐另一辆敞篷车。
车队在达拉斯蜿蜒10英里（16公里）的路线旨在让肯尼迪最大限度地接触人群，途经达拉斯郊区和市中心的主街，然后右转进入休斯顿街。再过一个街区，车队将左转进入埃尔姆街，穿过迪利广场，然后行驶一小段斯蒂蒙斯高速公路到达贸易市场。计划的路线几天前已在报纸上报道。尽管有人担心敌对的抗议者——肯尼迪的联合国大使阿德莱·史蒂文森一个月前在达拉斯被吐口水——肯尼迪还是受到了热情人群的热烈欢迎。
达拉斯市迪利广场的全景图，这是1963年11月22日肯尼迪总统遇刺的地点。
从休斯顿街，豪华轿车按计划左转进入埃尔姆街，经过德克萨斯教科书仓库。当它继续沿着埃尔姆街行驶时，响起了多声枪响：大约80%的目击者回忆听到三声枪响。沃伦委员会得出结论，认为开了三枪，并指出大多数目击者回忆第二声和第三声枪响靠得很近。肯尼迪开始挥手后不久，一些目击者听到了第一声枪响，但人群或车队中很少有人做出一定的反应，许多人将声音解释为鞭炮或汽车回火。
阴谋论者忽视了肯尼迪并非直接坐在康纳利后面，声称轨迹需要一颗“魔法子弹”
在彼此相差一秒内，康纳利州长和肯尼迪夫人突然从左转向右。康纳利——一位经验比较丰富的猎人——立即认出声音是步枪声，并将头和躯干转向右侧，注意到身后没什么异常。他作证说，他看不到肯尼迪，所以他开始再次向前转（从右转向左），当他的头部面向中心左侧约20度时，他被一颗他没听到的子弹击中了右上背部，然后喊道：“我的天哪。他们要杀了我们所有人！”
根据沃伦委员会和HSCA的说法，肯尼迪正在向右侧的人群挥手时，一颗子弹进入了他的上背部，并从喉结下方的喉咙射出。他抬起肘部，握紧拳头放在脸和脖子前面，然后向前和向左倾斜。肯尼迪夫人面对着他，用双臂抱住他。尽管伤势严重，但可能本可以存活。
根据沃伦委员会的单颗子弹理论——被阴谋论者嘲笑为“魔法子弹理论”——康纳利州长是被从肯尼迪脖子射出的同一颗子弹击伤的。子弹在康纳利肩膀附近造成了一个椭圆形的入口伤口，击中并摧毁了他右侧第五根肋骨的几英寸，并从他右下方的胸部射出，刺穿并使他的肺部塌陷。同一颗子弹随后进入他右手腕上方的手臂，击碎了他的右侧桡骨。子弹从他右手掌内侧的腕部下方射出，最终停留在他左大腿内。
另一张草图显示了致命击中肯尼迪头部的第二颗子弹的箭头。碎片从他的头骨中飞出。
当豪华轿车经过草丘时，肯尼迪第二次被击中，头部中了致命的一枪。沃伦委员会没有就这是开出的第二颗还是第三颗子弹做出结论，并得出结论——HSCA也是如此——击中肯尼迪的第二枪是从他的后脑勺进入的。然后，子弹碎片穿过了他的头骨，在头部后右侧形成了一个大的、“大致椭圆形”的洞，并喷溅出血液和碎片。他的脑浆和血迹溅到了后面的特勤局汽车和摩托车警官身上。
特勤局特工克林特·希尔骑在紧随肯尼迪豪华轿车后的汽车的踏板上。希尔向沃伦委员会作证说，他听到一声枪响，跳到街上，跑向前去登上豪华轿车保护肯尼迪。希尔说，当他到达林肯车时，听到致命的头部枪击声，这是在他听到的第一声枪响后“大约五秒”。头部中枪后，肯尼迪夫人开始爬上豪华轿车的后备箱，但她后来不记得这样做过。希尔认为她可能是在伸手去拿肯尼迪的头骨碎片。他跳上豪华轿车的保险杠，紧紧抓住车子，当它离开迪利广场并加速前往帕克兰纪念医院时。肯尼迪夫人爬回座位后，康纳利州长和夫人听到她反复说：“他们杀了我的丈夫。我手里有他的脑浆。”
旁观者詹姆斯·塔格在站在三重地下通道旁时，脸颊受了轻伤——要么是子弹，要么是混凝土路缘碎片。九个月后，FBI移除了路缘，光谱分析显示金属残留物与奥斯瓦尔德弹药中的铅芯一致。塔格在沃伦委员会前作证，最初说他是在他记得听到的三声枪响中的第二声或第三声时受伤的。当委员会律师要求他更具体时，塔格作证说他是被第二声枪响击伤的。
李·鲍尔斯在草丘栅栏后方120码（110米）处的两层铁路道岔塔内；他正在观看车队，并对枪手可能逃离草丘的唯一路线有无阻碍的视野；他没看到任何人离开现场。鲍尔斯向沃伦委员会作证说，在暗杀期间，他和栅栏之间有“一个或两个”人：一个是熟悉的停车场服务员，另一个穿着类似于县法院看守的制服。他作证说，在暗杀时看到了草丘上的“一些骚动”：“有些不寻常的事情，一种来回走动，但在那个特定地点发生了不寻常的事情，出于某种我无法确定的原因吸引了我的注意”。
中午12:36，少年阿莫斯·尤因斯接近达拉斯警察D.V.哈克尼斯中士，报告在暗杀期间看到一个“有色人种男子……从窗户探出身子[拿着]一支步枪”在仓库的六楼；作为回应，哈克尼斯通过无线电报告他正在封锁仓库。目击者霍华德·布伦南随后接近一名警察督察，报告在同一窗户看到一个枪手——一个穿着卡其布服装的白人男子。警方在中午12:45广播了布伦南对该男子的描述。布伦南作证说，在第二声枪响后，“这个人……正在瞄准他的最后一枪……可能又停顿了一秒钟，好像是为了确认和保证他击中了目标。”目击者小詹姆斯·R·沃雷尔也报告看到一支枪管从仓库六楼的窗户伸出。在仓库五楼的邦尼·雷·威廉姆斯说，步枪的声响如此响亮和接近，以至于天花板的灰泥掉到了他的头上。
从目击者霍华德·布伦南的角度看德克萨斯教科书仓库：圆圈“A”表示他看到奥斯瓦尔德开枪的步枪。
在搜索仓库六楼时，两名副警长发现了一支意大利卡尔卡诺M91/38栓动步枪。奥斯瓦尔德在去年3月以“A.希德尔”的化名购买了这支二手步枪，并将其寄送到他在达拉斯的邮政信箱。FBI在枪管上发现了奥斯瓦尔德的部分掌纹，步枪上的纤维与奥斯瓦尔德的衬衫一致。在康纳利州长的医院担架上发现的一颗子弹和在豪华轿车中发现的两个碎片与卡尔卡诺步枪的弹道相匹配。
奥斯瓦尔德离开仓库，乘公共汽车前往他的寄宿公寓，在那里他取了一件夹克和一把左。下午1:12，警察J.D.蒂皮特发现奥斯瓦尔德在橡树崖的住宅区行走，并叫他到他的巡逻车旁。在交谈几句后，蒂皮特下了车；奥斯瓦尔德随后向蒂皮特的胸部开了三枪。当蒂皮特躺在地上时，奥斯瓦尔德向蒂皮特的右太阳穴开了最后一枪。奥斯瓦尔德随后平静地走开，在目击者出现时开始奔跑。
当达拉斯警察对仓库员工做点名时，奥斯瓦尔德的主管罗伊·特鲁利发现奥斯瓦尔德不在，并通知了警方。基于对奥斯瓦尔德的错误识别，达拉斯警方在橡树崖突袭了一家图书馆，然后才意识到他们的错误。下午1:36，警方接到电话，称一个引人注目的奥斯瓦尔德在跑累后被看到偷偷溜进德克萨斯剧院而没有付钱。在电影《战争即地狱》仍在放映时，达拉斯警察在短暂的搏斗后逮捕了奥斯瓦尔德，奥斯瓦尔德在搏斗中拔出了他装满子弹的枪。他否认开枪射击任何人，并声称他因为曾在苏联生活而被当作“替罪羊”。
特勤局担心有几率存在更大的阴谋，敦促约翰逊离开达拉斯返回白宫，但约翰逊拒绝在没有肯尼迪死亡证据的情况下这样做。约翰逊在下午1:30左右返回空军一号，不久后，他接到了顾问麦乔治·邦迪和沃尔特·詹金斯的电话，建议他立即启程前往华盛顿特区。他回答说，他不会在没有杰奎琳·肯尼迪的情况下离开达拉斯，而她不会在没有肯尼迪的遗体的情况下离开。据《时尚先生》描述，约翰逊“不愿因抛下美丽的遗孀而被历史记住”
在肯尼迪遇刺时，总统谋杀案不属于联邦管辖。因此，达拉斯县法医厄尔·罗斯坚持认为德克萨斯州法律要求他进行尸检。肯尼迪的助手和达拉斯官员之间发生了一场激烈的争吵，差一点演变成拳斗，之后德克萨斯人让步，允许将肯尼迪的遗体运送到空军一号。下午2:38，在杰奎琳·肯尼迪的陪伴下，约翰逊在空军一号上由联邦法官莎拉·蒂尔曼·休斯主持宣誓就职，不久后带着肯尼迪的灵柩启程前往华盛顿。
在搞砸的尸检中，肯尼迪总统的尸检是典范。——迈克尔·巴登博士，众议院暗杀特别委员会法医病理学小组主席
肯尼迪总统的尸检于11月22日晚在马里兰州的贝塞斯达海军医院进行。杰奎琳·肯尼迪选择了一家海军医院作为验尸地点，因为肯尼迪总统在二战期间曾是一名海军军官。 尸检由三位医生进行：海军指挥官詹姆斯·休姆斯和J·桑顿·博斯韦尔，在弹道伤专家皮埃尔·A·芬克的协助下；休姆斯主持了程序。 在肯尼迪家族和白宫工作人员要求加快程序的压力下，医生们进行了一次“匆忙”且不完整的尸检。肯尼迪的私人医生、海军少将乔治·伯克利于11月23日签署了死亡证明，并记录死因是头部枪伤。
尸检三年后，当肯尼迪家族将材料移交给国家档案馆时，发现肯尼迪的大脑——曾被移除并保存以供日后分析——不见了。 阴谋论者经常声称，大脑可能显示头部枪伤是从前方进入的。或者，HSCA得出结论，司法部长罗伯特·F·肯尼迪（总统的兄弟）的一名助手可能在他的指示下移走了装有大脑和其他材料的脚柜，并且他“要么销毁了这些材料，要么以其他方式使它们无法访问”，以防止“滥用”所述材料或隐藏总统的慢性疾病和随之而来的药物医治的程度。一些尸检X光片和照片也已丢失。
大多数历史学家认为尸检是政府调查中“最糟糕”的部分。HSCA法医病理学小组得出结论，尸检有“广泛的失败”，包括未能拍摄足够的照片、未能确定头部子弹的确切出口或入口点、未解剖背部和颈部，以及忽视确定枪伤角度相对于身体轴线。该小组进一步得出结论，这两位医生没有资格进行法医尸检。小组成员米尔顿·赫尔彭——纽约市首席法医——说，选择休姆斯（他只上过一门法医病理学课程）来主持尸检“就像派一个上过三节小提琴课的七岁男孩去纽约爱乐乐团，并期望他演奏柴可夫斯基的交响曲”。
尸检后，肯尼迪在白宫东厅安息了24小时。约翰逊总统发布了第3561号总统公告，宣布11月25日为全国哀悼日，并且只有必要的紧急工作人员在岗。然后，灵柩被马拉的炮车运送到国会大厦供人瞻仰。数十万哀悼者排队观看守卫的灵柩，在18小时的瞻仰期间，有25万人通过圆形大厅。即使在苏联——根据FBI局长J·埃德加·胡佛的备忘录——暗杀的消息“引起了极大的震惊和恐慌，教堂的钟声为纪念肯尼迪总统而鸣响”。
肯尼迪的葬礼于11月25日在圣马修大教堂举行，由红衣主教理查德·库欣主持安魂弥撒。约有1200名客人参加，这中间还包括来自90多个国家的代表。虽然没有正式的悼词，助理主教菲利普·M·汉南朗读了肯尼迪的演讲和著作的摘录。仪式结束后，肯尼迪被安葬在弗吉尼亚州的阿灵顿国家公墓。1967年，在他的墓地点燃了一盏永恒的火焰。
11月24日星期日上午11:21，当奥斯瓦尔德被护送到达拉斯警察总部地下室的一辆汽车上，从市监狱转移到县监狱时，他被达拉斯夜总会老板杰克·鲁比开枪射击。枪击事件在电视上直播。达拉斯时代先驱报的罗伯特·H·杰克逊拍摄了这一枪击事件的照片，题为《杰克·鲁比射杀李·哈维·奥斯瓦尔德》，并因此获得了1964年普利策摄影奖。
奥斯瓦尔德时而清醒时而昏迷，被救护车送往帕克兰纪念医院；他由曾试图抢救肯尼迪的同一批外科医生治疗。子弹进入了他的左下胸部但没有射出；主要的心脏血管如主动脉和下腔静脉被切断，脾脏、肾脏和肝脏也被击中。尽管进行了手术干预和除颤，奥斯瓦尔德于下午1:07死亡。
枪击后立即被捕的鲁比向沃伦委员会作证说，他对肯尼迪的死感到心烦意乱，杀死奥斯瓦尔德是为了让“肯尼迪夫人免于回法庭受审的尴尬”。他还说，他是在机会出现时一时冲动射杀了奥斯瓦尔德，没考虑任何理由。最初，鲁比希望在审判中代表自己，直到他的律师梅尔文·贝利劝阻他：贝利辩称鲁比患有精神运动性癫痫发作，因此不负责任。鲁比被判有罪，但该决定在上诉后被推翻。1967年，在等待重审期间，鲁比死于肺栓塞，这是癌症的继发症。像奥斯瓦尔德和肯尼迪一样，鲁比在帕克兰医院被宣布死亡。
裁缝亚伯拉罕·泽普鲁德站在距离道路约65英尺（20米）的凉亭墙上，用26秒的无声8毫米胶片记录了肯尼迪被杀的过程——即著名的泽普鲁德胶片。[172]第313帧捕捉到了肯尼迪头部爆炸的确切瞬间。《生活》杂志在遇刺后不久刊登了泽普鲁德胶片的放大帧。这段录像本身于1969年在克莱·肖的审判中首次公开放映，并于1975年由杰拉尔多·里维拉在电视上播放。1999年，一个仲裁小组命令联邦政府向泽普鲁德的继承人支付每秒胶片615,384美元，将整部胶片估值1600万美元（相当于2022年的2750万美元）。
泽普鲁德是已知在迪利广场拍摄电影或静态照片的至少32人之一，这些照片是在枪击发生时或前后拍摄的。在摄影师中，最著名的是玛丽·穆尔曼，她用宝丽来相机拍摄了肯尼迪的几张照片，其中一张是在头部中枪后不到六分之一秒时拍摄的。
除了泽普鲁德，查尔斯·布朗森、玛丽·马奇莫尔和奥维尔·尼克斯也拍摄了遇刺事件，但距离比泽普鲁德更远。在这三人中，只有尼克斯——他从泽普鲁德对面的埃尔姆街拍摄，捕捉到了草丘——实际上记录了致命一枪。1966年，尼克斯声称，在他将胶片交给FBI后，他们归还的副本有帧“缺失”或“损坏”。尽管存在质量较低的副本，但原始胶片自1978年以来一直下落不明。此前未知的由乔治·杰弗里斯拍摄的录像于2007年发布。该录像在枪击前几个街区拍摄，捕捉到了肯尼迪的西装外套皱褶，解释了肯尼迪背部弹孔位置与外套之间的差异。
一些电影和照片捕捉到了一名身份不明的女性，她显然在拍摄遇刺事件；研究人员因她头上的披肩而给她起了个绰号“Babushka Lady”。1978年，戈登·阿诺德站出来声称，他从草丘拍摄了遇刺事件，一名警察没收了他的胶片。在该地区的任何照片中都看不到阿诺德，《重拾历史》的作者文森特·布格里奥西称之为“阿诺德的故事是编造的决定性摄影证据”。
……启程之前，肯尼迪看了几份达拉斯发行的报纸，充满了反肯尼迪的言论，没人喜欢他，憎恨意味浓厚，令他非常地担忧。……
……回到华盛顿后，我和杰基站着准备从（空军一号的）机尾下来，这时鲍勃上了飞机，跑过来，他抓住杰基，两人抱头痛哭，接着他陪她下了飞机，我尾随在后，然后我们上车，前往贝蒂斯海军医院。我们在医院时，鲍勃对我说：“你明天能否早点到办公室？约翰逊一行人已经到了。”我们到了贝蒂斯海军医院大楼的第十六或十七层，感觉有点像天主教的守灵。我们回忆着和肯尼迪一起做过的事、他对别人以及自己一生的贡献，杰基克制了伤痛，她凌晨3点左右过来对我说：“林肯太太，你先回去休息吧，接下来还有四天，要撑下去。”……
……1963年10月的某一天，当时担任美国驻联合国大使的阿德莱·史蒂文森打电话给我，他刚从得克萨斯州回来，他发现那里的气氛颇具敌意，反肯尼迪的情绪高涨，他在人潮中被推挤攻击，他说他知道总统打算去得州，他不知道这样的打算是否妥当。……
……好几个星期，好几个月，那次事件的恐惧每晚萦绕不去，我每晚都梦到自己遭到枪击，每晚重复着这些噩梦。在美国的历史上不曾发生过比约翰·肯尼迪遭暗杀影响国人更大的事件了……
……这是肯尼迪总统的主意，我们讨论了很久，他自从1960年大选之后就再也没有来过得克萨斯州。他很想来，其实是想为募款。他在前往达拉斯之前几个月，曾到埃尔帕索作短暂停留。我们当时就讨论过。他一开始想举办五场募款晚宴，吃个不停。副总统约翰逊和我获悉他的计划时差点晕了过去，因为我们觉得这是个天大的错误。……
……他们（反对派）认为他的政策太开放了，他常常谈论和平工作团、民权以及福利计划之类的话题。我曾和他共同拟定访问计划，最后终于同意成行。他说要让杰基一起去，我说希望他能说服得了她，大家都想见到她，尤其是妇女同胞们特别想见到她，她一定能帮上不少忙，这样就能消弭此行的政治意图，成为私人性质的访问。我们很希望她能来，他说应该能说服她一起来。……
……在到达迪利广场（Dealey Plaza）之前的路上，民众高喊着：“杰克！杰基！约翰！”他（肯尼迪）一路上不停地挥手道谢：“谢谢！谢谢！谢谢！……”她（杰基）也向民众致意，感觉真好，我觉得一切都如我预期的那样顺顺利利地进行。在车队转入休斯敦大街（Houston Street）时，我转身欣喜地对总统说：“总统先生，可别再说达拉斯不爱你了。”而就在几十秒后，枪击便发生了。……
……约翰也受了重伤，趴在我的身上，我不断轻声对他说：“不要动，没事了，你不会有事的，没事了……”有人说我当时大喊大叫，其实车里鸦雀无声，恐怖到了一点声音都没有。我们在高速上疾驰，经过了旁观的民众。我不禁想起这种景象……真可怕……人群看见这辆车疾驰而过，车上的两个女人抱着她们各自受伤的丈夫……
……11月21日我们在沃斯堡过夜，我记得第二天早上有一场演说，杰基没法到场。大家都暗自窃笑，因为演说会场是在饭店的停车场。肯尼迪就住在那家饭店。我记得当时他站在那里，说肯尼迪夫人今天早上有事耽误了，她没法到场，还在梳妆打扮。……
……我站在合众国际社的自动收报机前，此时合众国际社的白宫特派员梅里曼·史密斯发出了第一篇新闻快报，报道迪利广场发生了枪击事件。就在车队散开前往医院之后——总统显然是受伤了——我大喊：“快发布新闻，肯尼迪遭枪击了！”我们那天遇到了始料未及的状况，摄影机的锥光偏振管无法迅速地加热，除非事先加热机器，否则就没办法在十分钟内发布新闻。但我们在电视上打出字幕，以旁白的新闻快报形式播报。……
现在播报CBS的新闻快报。肯尼迪总统的车队在得克萨斯州达拉斯市区遭到歹徒开了三枪。事发之初据报，肯尼迪总统因枪击而导致重伤。
……事实显而易见，即使各大通讯社只以一小段文字明确地表示，仍清晰可见他（肯尼迪）撑不过这一关。他有一道致命伤，从小段的文字中就可以看出来。记得有一个记者对我说他死定了，我说：“上帝！…我知道他会死，但不必你来告诉我。”……
……在达拉斯拉菲尔德机场，大批民众前来欢迎总统。他逐一地向民众致意。肯尼迪夫人陪着他，她在当时也颇受民众爱戴。一切似乎进展的很顺利。州长和康纳利夫人也随侍在侧。接着他们坐上了轿车。……
……为了报道在达拉斯贸易博览会举行的午宴盛况，我们没跟随总统车队参加活动，而是提前赶到午宴会场。在下午12：45我们到达会场。进大厅时还不知道出了什么事，看到媒体记者就知道不对劲。大厅很宽敞，摆设了不少桌子，数百人等着与总统共进午餐。我事后告诉别人，那是我第一次见识到了谣言的可怕。谣言立刻传遍了大厅了的数百人。当时赫斯特报社的一名记者梅莉安·密兹拿起话筒打电话回纽约的办公室，另一端的人说：“我的上帝！你还不知道总统被枪杀了吗？”她转身大叫：“总统被枪杀了！”许多人这才明白出了什么事。我们回报了这条消息，纽约的人已经听到新闻快报了。……
……那天我刚下班，我星期五照例在下午可以休假半天。我打算炖些肉放进烤箱里，放进去之后要再等几个小时才可以取出来。于是当时我带着五岁大的儿子，去观看盛况。……
……他们（警察）领着我们前往对面的州立监狱那里，跟在我身后的记者们似乎希望我 出去发表一些谈话，于是我接受了他们的采访。我先前在烤箱里放的肉是为了星期六的聚会准备的，本以为我可以在看完之后就可以回去料理，但因需要做笔录，于是我想打电话找人帮我处理，可是他们（警察）不准我打电话，但愿意代劳。他们问我要打给谁，留什么话，我要他打电话给史密斯先生，请他关掉烤箱的电源，因为肉已经烤好了。对我来说，这句话不解自明，但对他们而言，这似乎是一句暗语。……
……当时起了内讧，得克萨斯州州长约翰·康纳利和资深参议员拉尔夫·亚伯洛之间彼此恶意地针锋相对。林登·约翰逊觉得此时去那里并不妥当。……
……大家都很担心，事件发生后，举国焦虑不已。约翰逊即将宣誓就职，其他几个国家想了解这一个即将继任世界第一大强国领袖的人是谁。所以后来我才知道，约翰逊决定提前宣誓就职，于是我们一定要先找到宣誓就职的誓文，我打电话给尼克拉斯·卡森巴赫，我后来才知道他是司法部副部长。我请他立刻把誓文给我们。就职仪式开始前，肯尼迪夫人应总统的要求从飞机的后方过来，我距离她不到一尺，可以仔细地看着她。她的眼神茫然，视而不见，我觉得她什么也没看见，她似乎在精神分裂的恍惚边缘。她上前来，低着头向下看，站在总统身旁，穿粉红色套装，上面不仅沾满了血迹，还有令人恐怖的白色块状物，想必那就是肯尼迪的脑浆。这种景象令人毛骨悚然，其他人特意地聚拢在一起。……
……宣誓完毕后，接着他（约翰逊）坐下，其他人或坐或站，他开始和几位参议员闲聊。然后他向我招手，我上前去，我蹲跪在旁边——因为他当时坐着——他低声对我在耳边说：“我要你加入我的内阁，我要你一起陪我飞回华盛顿。”我说：“是的，总统先生。”我不知道所谓内阁成员是啥意思，后来我问了两个愚蠢的问题，我说：“总统先生，我没有带衣服，只有手提包。”他说：“打电话给你太太，请她送几件衣服过来，你也可以到了那里再去买。”他看着我，以为我神志不清似的，在这种情况下我还担心没有衣服。接着我又问了第二个愚蠢的问题，我说：“总统先生，我没地方住。”他又看着我说：“跟我住吧。”仿佛我是从外太空来的白痴。……
……克里夫卡特、毕尔莫耶和我进了总统卧室，他换上睡衣躺在特大号的床上，大家一起看电视。电视上播放了一连串关于肯尼迪总统的影片，回顾他的年轻时代。我们正真看到凌晨三四点。约翰逊靠在床上看电视，在影片间隙说了些话，他开始概述理想社会的轮廓，但当时我们并不知情。当天晚上，他说想要评论肯尼迪的民权政策，这在参议院里普遍受到忽视，但他却这么做了。……
……肯尼迪总统身亡后，是我开车从帕克兰纪念医院将他的灵柩送回空军一号的。当时谣传有人密谋推翻政府，我们不知道出去会遇到什么事。外头可能还有持枪的歹徒，或许歹徒还想混进来。他们（联邦官员）开门让我们把灵柩抬出去，而州政府的人员则不允许。很多人都在咒骂。肯尼迪夫人站在灵柩后方，神父站在她旁边，他不断地洒上圣水祈福。灵柩上还有一个金属十字架，通常上面的十字架不会滑动，但他们用力地拉动灵柩，致使十字架在灵柩上移来移去。我试着固定它，不让它滑动。我们拉过来，他们又拉回去，好像永远也没完没了，其实只持续了十到十五分钟。然后终于有人上前来说：“让他们走吧。”……
……我走进办公室，和几个朋友坐在一起，我打电话给住在弗吉尼亚州希克利庄园家中的鲍勃，他说总统已经去世了，那是他刚听胡佛先生说的。他说胡佛先生打电话给他，很高兴地说说总统死了。他们俩一直处得不好。……
凶杀和抢劫局的队长J.W.弗里茨进行了大部分审问，并只保留了粗略的笔记。几天后，弗里茨根据他事后所做的笔记写了一份审问报告。没有速记或录音。其他执法机构的代表也在场，包括FBI和特勤局，并偶尔参与审问。几名在场的FBI特工撰写了同时期的审问报告。
FBI局长J.埃德加·胡佛在白宫，1963年5月摄于司法部长罗伯特·F·肯尼迪和总统约翰·F·肯尼迪之间
1963年12月9日，沃伦委员会收到了FBI的调查报告，该报告得出结论认为开了三枪——第一枪击中肯尼迪的上背部；第二枪击中康纳利；第三枪击中肯尼迪的头部，导致其死亡。FBI继续担任沃伦委员会在现场的主要调查机构。共有169名FBI特工参与此案，进行了超过25,000次访谈，并撰写了超过2,300份报告。
FBI调查的彻底性存在争议。布格里奥西赞扬其质量，并引用了阴谋论者哈里森·爱德华·利文斯通对FBI承诺追查所有线年的报告中，HSCA发现FBI对亲卡斯特罗和反卡斯特罗古巴人以及与奥斯瓦尔德或鲁比的任何联系的调查不足。HSCA还指出，胡佛“在暗杀事件发生后的24小时内似乎决心[认定奥斯瓦尔德是唯一的刺客]”。
11月29日，约翰逊总统通过行政命令成立了“总统肯尼迪遇刺委员会”，并选择美国最高法院首席官厄尔·沃伦担任调查主席，通常称为沃伦委员会。其888页的最终报告于1964年9月24日提交给约翰逊，并于三天后公布。报告得出结论，李·哈维·奥斯瓦尔德单独行动杀害了肯尼迪并伤及康纳利，杰克·鲁比单独行动杀害了奥斯瓦尔德。报告没有对奥斯瓦尔德的动机做出结论，但指出了他的马克思主义、反权威主义、暴力倾向、无法建立个人关系以及他希望在历史上具有重要性的愿望。
在审查泽普鲁德胶片时，委员会工作人员意识到FBI的枪击理论是不可能的。肯尼迪和康纳利的反应时间太接近，无法由奥斯瓦尔德的两颗子弹造成：反应间隔少于重新装弹所需的2.3秒。这是委员会最关键的发现之一：一颗子弹造成了肯尼迪和康纳利的非致命伤，即所谓的“单颗子弹理论”。1964年5月，工作人员阿伦·斯佩克特通过在迪利广场的重演复制了单颗子弹的轨迹：子弹的路径与肯尼迪和康纳利的伤口完全一致。
在八名委员会成员中，有三名——众议员黑尔·博格斯、参议员约翰·库珀和理查德·拉塞尔——认为该理论“不可信”；他们的疑虑未在最终报告中提及。阴谋论者将这一理论称为“魔法子弹理论”，部分原因是子弹完好无损且据称处于原始状态。然而，HSCA的迈克尔·巴登指出，尽管子弹没有碎裂，但从根本上变形了。2023年，特勤局特工保罗·兰迪斯——曾在肯尼迪汽车的踏板上——告诉《》，他在抵达帕克兰医院后立即从肯尼迪座位后面取回了“魔法子弹”，并将其放在肯尼迪的担架上。兰迪斯认为这颗子弹是从肯尼迪背部的一个浅伤口脱落的。
除了沃伦报告的27卷出版物外，委员会还创建了数十万页的调查报告和文件。雷尔曼·莫林表示，“历史上从未有过如此深入地调查犯罪”；布格里奥西得出结论，委员会的基本发现“经受住了时间的考验”。根据杰拉尔德·波斯纳的说法，沃伦报告“普遍受到美国公众的嘲笑”。[213] 沃尔特·克朗凯特指出，“尽管沃伦委员会拥有进行独立调查的全部权力，但它允许FBI和CIA自行调查——因此给答案蒙上了永久的阴影。”根据2014年CIA首席历史学家大卫·罗巴奇的报告，时任CIA局长约翰·A·麦科恩参与了“善意的掩盖”，向委员会隐瞒了信息。
克莱·肖（1951年照片）在不到一小时的审议后被新奥尔良陪审团无罪释放。
1967年3月22日，新奥尔良地区检察官吉姆·加里森逮捕并指控新奥尔良商人克莱·肖与奥斯瓦尔德、大卫·费里等人共谋刺杀肯尼迪总统。肖是一位受人尊敬的商人，曾帮助翻新和保护法国区，被描述为“自奥斯卡·王尔德以来最不可能的恶棍”。肖和神经质、热衷反卡斯特罗的费里都是新奥尔良同性恋社区的成员。费里可能自杀身亡，在调查消息传出四天后去世。在1968年的《约翰尼·卡森今夜秀》节目中，加里森首次公开声称肖和费里参与了CIA的更大阴谋，旨在杀害肯尼迪并陷害奥斯瓦尔德。在1969年进行的为期34天的审判中，加里森播放了泽普鲁德胶片，并辩称肯尼迪头部在致命一枪后的向后运动表明草丘上有枪手。
经过短暂的审议，陪审团认定肖无罪。马克·莱恩在审判后采访了陪审员，并表示有些人认为肖可能参与了阴谋，但证据不足以定罪。莱恩的说法受到了剧作家詹姆斯·柯克伍德的质疑，柯克伍德是克莱·肖的私人朋友，他说自己遇到了几名否认曾与莱恩交谈的陪审员。柯克伍德还质疑莱恩声称陪审团认为存在阴谋的说法：陪审团领班西德尼·赫伯特告诉柯克伍德，“我在审判前对沃伦报告也没什么好感。现在我对它的看法比以前好多了。”
根据学者E.杰拉尔德·奥格的说法，肖的审判现在被广泛认为是一场“司法的闹剧”；柯克伍德将审判比作西班牙宗教裁判所的听证会。其他观察者则认为诉讼程序依赖于恐同情绪。这仍然是唯一一次为肯尼迪遇刺案进行的审判。1979年，前CIA局长理查德·赫尔姆斯作证说，肖曾是CIA国内联系服务部门的兼职联系人，通过该部门肖自愿提供他在国外旅行时获得的信息，主要是到拉丁美洲。然而，根据马克斯·霍兰德的说法，约有15万美国人是联系人。1993年，PBS节目《前线年民航巡逻队野餐的集体照，照片上有费里和奥斯瓦尔德：费里曾否认认识奥斯瓦尔德。
由司法部长拉姆齐·克拉克(1968年与总统林登·B·约翰逊合影)组织的专家小组发现两颗子弹从后面击中了肯尼迪。
除首席官沃伦外，沃伦委员会的成员没有查看肯尼迪尸检期间拍摄的照片或X光片。据沃伦说，这是为了尽最大可能避免向“炒作者”公开发布露骨材料。由于持续的猜测，1968年2月，司法部长拉姆齐·克拉克召集了一个由四名医学专家组成的小组，审查肯尼迪尸检的照片和X光片。他们的发现与沃伦委员会一致：肯尼迪被两颗从后面射来的子弹击中。
经过五个月的调查，洛克菲勒委员会向福特总统提交了报告。报告审核检查了医学证据，并同意肯尼迪被两颗从后面射来的子弹杀害。反驳了加里森关于泽普鲁德胶片上肯尼迪头部向后运动表明草丘上有枪手的说法，委员会发现“这种运动是由身体的剧烈伸直和僵硬引起的，这是对大脑神经中枢遭受重大损害的癫痫发作样神经肌肉反应的结果”。后来的HSCA建议，“从出口伤口喷出的脑物质导致的推进效应”可能是原因。病理学家文森特·迪马约在HSCA前作证说，“动量传递”的概念是没有根据的，是“阿诺德·施瓦辛格电影”中的东西。
洛克菲勒委员会还试图确定CIA特工——特别是E.霍华德·亨特和弗兰克·斯特吉斯——是否在遇刺时出现在迪利广场，以及他们是否是遇刺后不久拍摄的“三名流浪汉”中的一员。委员会未曾发现这些说法的证据。它还调查了CIA与奥斯瓦尔德和鲁比之间的所谓联系，但未曾发现证据，并认为这是“牵强附会的猜测”。他们得出结论，“没有可信的证据说明CIA去参加了”。
1975年，在水门丑闻和西摩·赫什揭露CIA不当行为（CIA所谓的“家族珠宝”）之后，美国参议院成立了美国参议院关于政府情报活动的特别委员会——因其主席、参议员弗兰克·丘奇而被称为丘奇委员会。该委员会的目的是调查CIA和FBI的所有不当和非法行为，无论是国外还是国内。由于持续的理论，丘奇委员会组织了一个小组委员会（由参议员理查德·施魏克和加里·哈特组成），以审查CIA和FBI在遇刺事件中的行为。
在其最终报告中，丘奇委员会得出结论，没有证据说明存在CIA或FBI主导的阴谋。他们发现对奥斯瓦尔德责任的原始调查是“有缺陷的”，并批评FBI和CIA没有向沃伦委员会提供信息。特别是，它指出，了解CIA多次暗杀卡斯特罗的失败尝试可能会明显影响调查的进程。此外，丘奇委员会揭示，CIA在这些针对卡斯特罗的阴谋中与黑手党勾结。这些启示导致了对遇刺事件的进一步公众审查。
一幅插图显示了击中肯尼迪的子弹在进入康纳利皮肤前旋转和翻滚，造成了他的入口伤口。
HSCA的调查持续到1978年，并于次年发布了最终报告，得出结论肯尼迪很可能是阴谋的结果。他们得出结论，“有很高的概率”从草丘开了第四枪，但表示这枪没有击中肯尼迪。关于“有几率存在阴谋”的结论，十二名委员会成员中有四名撰写了异议意见。
HSCA还得出结论，先前对奥斯瓦尔德责任的调查是“彻底且可靠的”，但没有充分调查阴谋的可能性，并且联邦机构的表现“在能力方面不一样”。具体来说，FBI和CIA在与其他机构和沃伦委员会共享信息方面存在缺陷。FBI和CIA没提供所有相关信息，而只是回应特定请求，并且偶尔仍然不足。此外，特勤局在遇刺前没有妥善分析其掌握的信息，并且在保护肯尼迪方面准备不足。
“可能存在阴谋”的根本原因是，根据报告的异议意见，是后来被否定的警方频道Dictabelt录音的声学分析。根据HSCA的建议，Dictabelt录音和第二名刺客的声学证据随后被重新审查。根据FBI技术服务部门和特别任命的国家科学院委员会的调查报告，确定“可靠的声学数据不支持存在第二名枪手的结论”，司法部得出结论，“没有令人信服的证据能支持肯尼迪遇刺案中的阴谋理论”。
奥利弗·斯通1991年的电影《JFK》促成了“JFK法案”，该法案要求发布所有相关的。
1991年，奥利弗·斯通的电影《JFK》重新激发了对遇刺事件的兴趣，特别是对与杀害有关的仍未解密文件的兴趣。作为回应，国会通过了JFK记录法案，要求国家档案馆在25年内收集并发布所有与遇刺相关的文件。该法案还要求设立一个独立的办公室，暗杀记录审查委员会，审查提交记录的完整性和持续保密。从1994年到1998年，暗杀记录审查委员会收集并解密了约60,000份文件，包括超过400万页。
1998年，暗杀记录审查委员会的一份工作人员报告认为，肯尼迪记录中的大脑照片可能不是肯尼迪的大脑，据报道显示的损害比肯尼迪遭受的要少。博斯韦尔博士驳斥了这些指控。委员会还发现，与显示没有此类缺陷的摄影图像相冲突，几名目击者（在帕克兰医院和尸检时）记得肯尼迪后脑勺有一个大伤口。委员会和委员会成员杰里米·冈强调了目击者证词的问题，敦促人们权衡所有证据，适当关注人为错误，而不是将单一陈述作为一种理论或另一种理论的“证据”。
所有剩余的与遇刺相关的记录计划于2017年10月前发布，除非继任总统因“对军事、国防、情报行动、执法或外交关系造成的可识别损害……其严重性超过公众利益”而认证文件继续推迟。唐纳德·特朗普总统在2017年10月表示，他不会阻止文件的发布，但在2018年4月——他设定的发布所有JFK记录的截止日期——特朗普阻止了一些记录的发布，直到2021年10月。乔·拜登总统以COVID-19疫情为由进一步推迟了发布，然后在2022年发布了13,173份未编辑的文件。2023年6月，解密了第二批文件，此时99%的文件已公开。
肯尼迪遇刺事件被描述为“所有阴谋论之母”。几十年来，民意调查始终发现大多数美国人相信存在阴谋；大约有1000到2000本书——大多支持阴谋论——关于这次暗杀事件被撰写。在不同的理论中，奥斯瓦尔德的角色从同谋到完全无辜不等。常见的嫌疑人包括联邦调查局（FBI）、中央情报局（CIA）、美国军方、黑手党、军工复合体、副总统约翰逊、卡斯特罗、克格勃，或是它们的某种组合。布格里奥西估计，共有42个团体、82名刺客和214人曾在各种暗杀理论中被指控。
阴谋论者经常辩称有多名枪手——“交叉火力的三角定位”——致命一枪是从草丘射出的，击中了肯尼迪的头部前方。迪利广场上的个人成为许多猜测的焦点，包括三名流浪汉、雨伞人和所谓的“徽章人”。阴谋论者认为尸检和官方调查存在缺陷，或者在最坏的情况下是共谋，并且肯尼迪遇刺事件的目击者遭遇了神秘和可疑的死亡。
阴谋论得到了知名人士的支持，例如肯尼迪时期参谋长联席会议特别行动主任L.弗莱彻·普劳蒂，他认为美国军方和情报界的一些人密谋刺杀了总统。康纳利州长也拒绝了单颗子弹理论，据报道，约翰逊总统在去世前对沃伦委员会的结论表示怀疑。据罗伯特·F·肯尼迪Jr.称，他的父亲认为沃伦报告是“粗制滥造的作品”，约翰·F·肯尼迪是被阴谋杀害的，可能涉及古巴流亡者和中央情报局。卡斯特罗和苏联领导人尼基塔·赫鲁晓夫等统治者认为肯尼迪是被美国右翼分子杀害的。前中央情报局局长R.詹姆斯·伍尔西辩称，奥斯瓦尔德是作为苏联阴谋的一部分杀害了肯尼迪。
11月27日——暗杀事件发生五天后——约翰逊总统向国会发表了“让我们继续”的演讲。这篇演讲其实就是一次就职演说，约翰逊呼吁实现肯尼迪的政策，特别是关于民权，这很快以1964年的《民权法案》的形式实现。围绕约翰逊继任的混乱导致了1967年通过的美国宪法第二十五修正案，该修正案确认副总统在总统去世时成为总统。
11月29日，约翰逊总统发布了第11129号行政命令，将佛罗里达州的卡纳维拉尔角——一个至少自1530年以来就使用的名字——更名为肯尼迪角。位于该角的美国国家航空航天局（NASA）发射操作中心也被更名为肯尼迪航天中心。联邦政府还通过其他方式纪念肯尼迪，例如用肯尼迪半美元取代本杰明·富兰克林半美元，并将华盛顿特区长期规划的国家文化中心更名为约翰·F·肯尼迪表演艺术中心。纽约市的机场也被更名为约翰·F·肯尼迪国际机场。
他们说他们没办法相信；这是一种亵渎的耻辱。现在，谁会想伤害这样一个游戏英雄？
约翰·F·肯尼迪的暗杀是1960年代四次重大暗杀事件中的第一次，比1965年马尔科姆·X的暗杀早两年，比1968年马丁·路德·金和罗伯特·F·肯尼迪的暗杀早五年。对公众来说，肯尼迪的暗杀将他神话为一个英雄人物。尽管学者们通常认为肯尼迪是一位好但不伟大的总统，但民意调查始终发现他是二战后最受欢迎的总统。
肯尼迪的谋杀在整个世界许多人心中留下了持久的印象。就像1941年12月7日的珍珠港袭击，以及后来的2001年9月11日袭击一样，询问“当你听到肯尼迪总统遇刺时，你在哪里？”成为了一个常见的讨论话题。记者丹·拉瑟认为，肯尼迪遇刺事件将“在一百年后，一千年后，以某种类似于人们讨论《伊利亚特》的方式被讨论。不同的人阅读荷马对战争的描述，得出不同的结论，肯尼迪的死亡也将如此”。
除了奥利弗·斯通的《JFK》，遇刺事件还在多部电影中被描绘：支持阴谋论的、由道尔顿·特朗博编剧的《行政行动》（1973年）是第一部描绘遇刺事件的故事片。除了明确的描绘，一些评论家认为，泽普鲁德胶片——它本身在许多电影和电视集中被使用——推动了真实电影的发展，或启发了美国电影中更直白的暴力描绘。许多文学作品也探讨了这次暗杀，例如唐·德里罗1988年的小说《天秤座》，其中奥斯瓦尔德是中央情报局特工，詹姆斯·埃尔罗伊1995年的作品《美国小报》，以及斯蒂芬·金2011年的时间旅行小说《11/22/63》。遇刺事件还被纳入了多部音乐作品中，例如伊戈尔·斯特拉文斯基1964年的作品《J.F.K.的挽歌》和菲尔·奥克斯1966年的歌曲《十字架》，据说这首歌让罗伯特·肯尼迪流下了眼泪。其他歌曲包括《亚伯拉罕、马丁和约翰》（1968年）和鲍勃·迪伦的《最卑鄙的谋杀》（2020年）。
在迪利广场的埃尔姆街上，一个涂成白色的“X”标记着致命子弹击中肯尼迪的地点。
在遇刺时用作空军一号的波音707在美国空军国家博物馆展出；肯尼迪的豪华轿车在亨利·福特博物馆。肯尼迪的灵柩在国会大厦安放时所用的林肯灵柩台，现陈列在国会游客中心。杰奎琳的粉色套装、尸检X光片和肯尼迪总统的染血衣物保存在国家档案馆，访问权由肯尼迪家族控制。档案馆中的其他物品包括帕克兰医院创伤室设备；奥斯瓦尔德的步枪、日记和左；子弹碎片；以及豪华轿车的挡风玻璃。德克萨斯州档案馆保存了康纳利被子弹打穿的衣物；鲁比用来杀死奥斯瓦尔德的枪归鲁比的兄弟厄尔所有，并于1991年以22万美元（相当于2024年的51万美元）售出。
“……肯尼迪是那一代人中的一个，一个奇异新世界的雄辩的代言人。自从威尔逊总统之后，没有一点总统比他更相信理想的力量。他的敏捷机智使他出色地掌握了总统的职责范畴。他的非凡智慧发展出一套从政哲学，罕见的口才使他显得幽雅和不凡……”
“……当国家的伟人们去世的时候，他们的成就会被牢记。肯尼迪之死的悲剧在于，我们也不得不哀悼那些未竟的事业。我们感到我们的未来已经被出卖了……”
